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Nat Biotechnol :深度表述!科学家成功清楚地绘制出人类肠道的微生态系统目录!

2021-11-22 06:33:08 来源:
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近日,一项发表在国际间刊物Nature Biotechnology上篇名“A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome”的分析报告中会,来自欧洲各国有机学研究所等机构的研究小组们通过分析将进化小肠有机两组中会所有仅有的大肠杆菌基因选集成了一个大型的目录,从而就能尽力分析执法人员深入即使大肠杆菌基因和细胞之间的关联,以及其对进化卫生的阻碍。

大肠杆菌有数体内内外,其都能归因于细胞质来阻碍机消化、卫生和对疾病的易感性,其如此普遍以至于体内有机两3人的存量要比体内细胞还要多,还包括大肠杆菌、地衣和其它有机;为了思考大肠杆菌在进化生物学中会所充当的关键因素角色,研究小组们多半会在研究所中会受控并对其培养,随后在对大肠杆菌透过DNA基因,然而以外很多大肠杆菌还未在研究所的生态环境中会被培养越冬。

为了授予这些大肠杆菌的相关信息,分析执法人员采取了另外一种作法,他们从生态环境中会(比如小肠)采集举例来说样品,随后在对整个样品中会的DNA透过基因,然后利用计算机作法对来自举例来说样品中会的数千种类群的个体基因透过重修,这种作法被称之为宏基因学新技术,该新技术能作为一种替代作法对单个类群的DNA透过受控和基因。

学者Rob Finn坚称,去年还包括我们在内的三个独立的团队重修了成千上万个小肠有机两组基因,而仅有的问题就是这些的团队所得到的结果到底具有单一性,以及到底能将这些结果选集成为一个极为全面的详细信息。以外分析执法人员已经从进化小肠中会大约4600种大肠杆菌分布区中会选集了20万个基因和1.7亿个细胞质序列,这种新型的目录(统一的进化胃小肠基因集合和统一的胃小肠细胞质目录)阐释了机小肠的前所未见多样性,并为进一步透过小肠有机两组分析走上了巷道。

学者绘制出的这个前所未见的目录是有机两组分析的一个里程碑,更进一步或将能为研究小组们包括极为宝贵的资源来分析进化小肠生态中会每一种大肠杆菌所充当的关键因素角色。这项分析表明,大约70%被检测到的大肠杆菌从而在研究所中会被顺利培养过,而其在体内的活性仅仅未知,而这类大肠杆菌中会仅有的社会群体就是Comantemales;学者坚称,看到Comantemales如此广泛真是一个惊喜,这就引人注意了我们的确对小肠中会的大肠杆菌知之甚少,我希望这个目录能尽力生物信息学家和有机学家在更进一步几年以致于这一知识空白。

该目录/目录采集的所有数据都能在在线资源Mgnify中会授予,其能尽力研究小组们分析有机的基因数据并且与当前的目录透过对比;随着欧美分析的团队不断公开发表新的目录,该目录可能缩小到还包括其它机指甲的有机两组,比如黏膜或口腔内部等指甲。再次学者坚称,这一目录的选集更进一步或为有机学家和临床分析执法人员包括极为丰富的资源,然而分析执法人员可能在南美洲、亚洲和非洲等标志性过剩的周边地区发现更多新的大肠杆菌类群,以外分析执法人员不一定清楚各不相同群体中会大肠杆菌多样性的相似之处和变化具体情况。

原始出处:

Alexandre Almeida, Stephen Nayfach, Miguel Boland, et al.A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome.Nat Biotechnol. 2020 Jul 20. doi: 10.1038/s41587-020-0603-3.

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